Quando uma sessão de tela é criada pela primeira vez, nenhuma janela é selecionada. Assim, quando você envia seus comandos, a tela não sabe para qual janela enviar. Depois de ter anexado à tela, no entanto, a janela foi selecionada, razão pela qual você pode enviar comandos depois de fazer isso. Para selecionar uma janela na linha de comando, você precisa usar a opção -p
.
Aqui está uma modificação do seu comando que deve funcionar:
screen -S new_screen -p 0 -X stuff "cd /some/path/
some_script_file.sh
"