Isso parece ser um bug no wget: link
Aparentemente, o wget não analisa corretamente o escopo adicionado ao endereço IPv6 do link local.
Eu recomendaria dar ao (s) seu (s) servidor (es) endereços IPv6 reais, públicos ou, se você não puder obtê-los, ULAs (endereços locais exclusivos). Eles funcionam sem identificador de escopo e, portanto, também funcionam no wget.