Eu tive o mesmo problema de "Screen 1 deleted" no teste Debian com o kernel 4.9. Resolvi adicionar as seguintes linhas a /etc/bumblebee/xorg.conf.nvidia
, conforme descrito aqui link :
Section "Screen"
Identifier "Default Screen"
Device "DiscreteNvidia"
EndSection
Eventualmente, tente também definir o BusID manualmente no mesmo arquivo, encontrando-o com lspci | egrep 'VGA|3D'
.