Você pode tentar este awk
awk -F"," 'NR != 1 { if ((x - $3) >= 50) print $0; } { x = $3 }' file
e este se você não quiser imprimir linha se arquivado $1
alterado:
awk -F"," 'NR != 1 { if ($1 == fc && (x - $3) >= 50) print $0; } { x = $3; fc = $1; }' file