Se tudo mais falhar, você pode alterar a configuração no arquivo de configuração manualmente:
window.justify in theme.cfg can be left, right. or center.
( fonte: Frank McCormick na lista de discussão dos usuários do fluxbox )
Os temas para todo o sistema estão em /usr/share/fluxbox/styles , e os temas locais do usuário estão em ~/.fluxbox/styles/ .