Resposta curta:
Não.
Resposta longa:
Ao instalar pacotes através de seu gerenciador de pacotes ( apt , que depende de dpkg ), os arquivos no arquivo .deb são extraídos e movidos para o lugar onde deveriam estar. Os arquivos de configuração vão para /etc , binários para /usr/bin ou outros bin dirs, bibliotecas para /lib , etc. O padrão que especifica qual arquivo vai para onde está o FHS (File Hierarchy Standard). Se você fizer alterações nos diretórios de instalação, provavelmente violará esse padrão. De qualquer forma, dpkg tem uma opção --instdir , mas isso atrapalharia as coisas se usado globalmente.
Responda ao seu problema REAL:
Como eu li no seu comentário, a razão pela qual você quer fazer isso é porque você ficou sem espaço na sua partição raiz, mas você ainda tem muito em /usr/local .
Alterar o diretório de instalação não é uma solução, você deve reparticionar seu disco rígido. Você pode redimensionar partições se não quiser reinstalar o sistema (o que não é necessário). Tente inicializar um sistema de particionamento ao vivo, como o GParted, se você preferir ferramentas gráficas (para a linha de comando, confira parted e fdisk ).
A outra solução (eu prefiro isso, pois permite mais flexibilidade no futuro) é configurar LVM . LVM significa Logical Volume Management, que permite (além de outras características impressionantes) redimensionar partições sem perder dados e ter que reparticionar seu disco rígido. É um pouco complicado demais para ser explicado aqui, mas existem ótimos guias sobre isso. Um desses é HowToForge e você também pode verificar o relevante ArchWiki .