Você pode usar o pam_mount.
Leia o passo 5 deste mini tutorial que Anda por isso. Por favor, note que há um problema de segurança com isso.
Como posso montar automaticamente uma unidade EncFS no login / iniciar minha sessão? Eu uso o Fedora 20 e o KDE. Por favor, não mencione aplicativos como Cryptkeeper e assim. Eu preferiria consolar as soluções.