Eu tenho um arquivo csv com os seguintes cabeçalhos - Interaction_ID, PDB_ID, First_Residue, First_Chain, Second_Residue, Third_Residue, Third_Chain & Padrão:
AM_AUTO_1,1cx0,A166,B,C118,B,G129,B,A-minor Type I ACG
AM_AUTO_2,1cx0,A165,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_3,1cx0,A166,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_4,1ddy,A25,A,C21,A,G8,A,A-minor Type I ACG
AM_AUTO_5,1e7k,A33,C,C28,C,G45,C,A-minor Type 0 AGC
AM_AUTO_6,1e7k,A33,D,C28,D,G45,D,A-minor Type 0 AAU
O que eu gostaria de fazer é excluir linhas no arquivo csv onde Padrão =% Digite 0% e, em seguida, imprima o arquivo csv resultante. O resultado deve ser assim:
AM_AUTO_1,1cx0,A166,B,C118,B,G129,B,A-minor Type I ACG
AM_AUTO_2,1cx0,A165,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_3,1cx0,A166,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_4,1ddy,A25,A,C21,A,G8,A,A-minor Type I ACG
Como eu posso fazer isso usando o awk?
Com awk , você pode fazer:
$ awk '$(NF-1)!=0' file
AM_AUTO_1,1cx0,A166,B,C118,B,G129,B,A-minor Type I ACG
AM_AUTO_2,1cx0,A165,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_3,1cx0,A166,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_4,1ddy,A25,A,C21,A,G8,A,A-minor Type I ACG
ou usando grep :
grep -v 'Type 0' file
Usando awk :
awk -F, '$9!~/Type 0/{print $0}' file
AM_AUTO_1,1cx0,A166,B,C118,B,G129,B,A-minor Type I ACG
AM_AUTO_2,1cx0,A165,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_3,1cx0,A166,B,C119,B,G128,B,A-minor Type II ACG
AM_AUTO_4,1ddy,A25,A,C21,A,G8,A,A-minor Type I ACG
Explicação:
Isso faz com que awk use , como delimitador ( -F, ). Se o nono campo não contiver "Tipo 0" ( $9!~/Type 0/ ), imprima a linha ( {print $0} ).
E uma solução sed :
sed '/,[^,]*Type 0[^,]*$/d' file
Tags awk csv-simple