Eu conheço sua dor, depois da hibernação meu computador fica muito mais lento.
Mas há outro caminho. Chama-se TuxOnIce .
É muito mais rápido que a hibernação no kernel e é capaz de salvar TODA a memória em uso, incluindo os caches de disco. Faz uma enorme diferença e, na verdade, torna a hibernação no Linux utilizável no dia a dia.
Cuidado - isso envolve construir seu próprio kernel. Se você é um usuário Debian ou Ubuntu, isto é bastante fácil usando o kernel-package (make-kpkg). Boa sorte!