Estou executando o Fedora 16 e o Skype. E eu tenho o Empathy instalado. A empatia não tem nenhum requisito (explícito ou implícito) no libvpx:
# rpm -q --requires empathy | grep -i vpx
E, de fato, muito poucas coisas dependem disso diretamente:
# rpm -e libvpx
error: Failed dependencies:
libvpx.so.1()(64bit) is needed by (installed) xulrunner-10.0-1.fc16.x86_64
libvpx.so.1()(64bit) is needed by (installed) gstreamer-plugins-bad-free-0.10.22-2.fc16.2.x86_64
Eu tenho este pacote do Skype instalado:
# rpm -q skype
skype-2.2.0.35-fc10.i586
E esta versão do libvpx:
# rpm -q libvpx
libvpx-1.0.0-1.fc16.x86_64
De fato, a libvpx 0.9.7 não parece estar disponível nos repositórios do Fedora 16.
Eu me certificaria de que todos os seus pacotes existentes realmente vieram dos repositórios do Fedora 16.