Também tenho este problema e encontrei uma solução alternativa. O bug está relacionado ao mais novo kernel do Linux (eu tenho esse bug no kernel genérico do 4.8.0-56 no Ubuntu MATE). Após inicializar o sistema usando o kernel 4.8.0-54-genérico, o plugin Java parou de travar. Ainda bem que não usei o apt-get autoremove desta vez para remover kernel antigo:).