Você pode fazer isso usando o cron e o ntpdate.
Primeiro defina o seu fuso horário. Por exemplo,
timedatectl set-timezone America/New_York
Crie um arquivo no cron.d tendo o comando ntpdate para sincronizar o tempo com o servidor ntp.
vim /etc/cron.d/ntpdate
adicione a linha abaixo mencionada no arquivo
*/5 * * * * ntpdate 0.pool.ntp.org
Se você tiver um servidor ntp interno, aponte para isso em vez de ntp.org.
Isso sincronizará a hora do sistema com o servidor ntp a cada 5 minutos.