New User Executando um script com qsub

Question

Peço desculpas antecipadamente, sou um novo usuário, portanto, detalhamentos muito detalhados são muito bem-vindos. Eu copiei um script que eu preciso para executar o meu diretório de outras pessoas. Eu preciso executar isso usando o qsub. Eu tentei o óbvio "qsub script "
O erro "arquivo deve ser um script ascii" apareceu. Uma pesquisa rápida no google me disse que um script de shell é necessário, mas eu não sei o que isso significa, nem sei como escrever um. Pode ser interessante que eu também tenha sido instruído a copiar um arquivo chamado qsub. exemplo também, o que eu acho que é provavelmente relevante.

Mais uma vez, peço desculpas pela minha falta de experiência aqui, não recebi muita ajuda ou orientação para trabalhar aqui. Eu gostaria apenas de executar este script.

    

Answer 1

Tudo bem, então crie um arquivo e vamos chamá-lo de run.sh. Um shell script é como um arquivo bat no Windows, projetado para ser executado em um interpretador de linha de comando. Nós vamos usar o shell Bash para isso.

#!/bin/bash 

Significa que este arquivo usa o interpretador Bash. / bin / bash refere-se ao caminho absoluto do interpretador no sistema de arquivos.

Então, de acordo com o link , imagino que você gostaria de algo assim escrito em run.sh:

#!/bin/bash

cd $PBS_O_WORKDIR
./script 

E, em seguida, para executar com qsub:

qsub run.sh

$ PBS_O_WORKDIR é uma variável de ambiente que se refere ao caminho absoluto do diretório de trabalho atual no qual você chamou o comando qsub.

O erro que você estava recebendo, "arquivo deve ser um script ASCII", significa apenas que o qsub quer um script de shell para seu argumento em vez de seu arquivo de exemplo.

Espero que isso ajude!