Eu tive o mesmo problema. Surpreendentemente, desinstalar xserver-xorg-input-vmmouse ajuda.
apt-get remove --purge xserver-xorg-input-vmmouse
Eu tenho um problema no debian sid com o ambiente de desktop gnome onde meu mouse não funciona após o login. Meu teclado ainda está totalmente funcional e eu tentei reinstalar o gnome e o gdm3 através de um tty. Eu tenho as últimas ferramentas de convidado para o player de workstation vmware 12 instalado. Eu verifiquei os logs de erro e não encontrei nada de uso (se você precisar / gostaria de ver os logs apenas comentar sobre o que você precisa, ex. Xorg, usuário, etc.)
Minha instalação está totalmente atualizada.
Só para esclarecer, o mouse funciona bem até eu entrar no gnome, ponto em que ele pára de funcionar.
Estou usando essa máquina virtual em um laptop e experimentei meu touchpad, mas ele também não responde.
O mouse / touchpad não responde a clicar, no entanto, se eu abrir um terminal no gnome via ctrl + alt + to cursor será atualizado para mostrar um "I" como se estivesse digitando, mas ainda não responde completamente meu mouse / touchpad.
Eu não tenho ideia de como corrigir esse problema e estou perguntando se alguém tem alguma ideia de como corrigir / depurar esse problema?
UPDATE
Este problema é causado pelo VMware não ter suporte para o Xorg 7.7 e até que eles corrijam o problema, há pouco que pode ser feito.
Se você gostaria de tentar jogar com as configurações e configurações do Xorg 7.7, então talvez este site poderia ajudar.
Talvez eu tenha o mesmo problema.
Eu encontrei o seguinte é a solução alternativa.
$ sudo -E startx
Mas esta solução alternativa tem muitos problemas. Espero por completo solução.
UPDATE
A seguinte solução alternativa é melhor, mas também tem problemas.
$ sudo chmod u+s /usr/lib/xorg/Xorg