Inicialmente, você pode não perceber nada, pois o kernel não necessariamente percebe mudanças na tabela de partição. É por isso que você é solicitado por fdisk
que precisa reiniciar o sistema, por exemplo, se você mudou as partições no disco que você iniciou (você pode no entanto notificar o kernel com um programa disso).
Se a memória in (kernel) e nos layouts das partições de disco não corresponderem, o kernel grava feliz onde provavelmente não seria capaz de ler após uma reinicialização e reler as informações da partição.