Não há opção para alterar a base do número do item exibido no menu. Você menciona na sua pergunta "... mesmo alguns usuários bash menos experientes saberiam (sobre) ... índice 0".
Sim, isso está correto, mas o menu select
não foi criado para bash users (leia-se "programadores") - foi destinado a usuários finais ( pré GUI era)
quem normalmente não sabe (ou se importa) nada sobre bash. Estar confortável com uma lista baseada em zero é uma coisa do programador (daí sua preferência), mas definitivamente não é algo que um usuário final está acostumado, afinal.