O FFmpeg pode fazer isso
ffmpeg -i infile.flac -c copy outfile.mp3
Eu tenho vários arquivos FLAC que estou convertendo em arquivos MP3 com o seguinte:
flac -cd file.flac | lame ... - file.mp3
Existe algum utilitário que copie os metadados Vorbis (FLAC e OGG), converta-os em tags ID3 apropriadas e marque um MP3 com as mesmas tags que o arquivo FLAC?