Eu não tenho o Elementary (ou qualquer coisa baseada no Debian) na minha frente para testar, mas acho que você está certo em identificar essa linha como a fonte da confusão.
As instruções que você vincula têm alguns passos assumidos. Depois de baixar o pacote de origem, você deve descompactá-lo (com tar xvf filename ) e, em seguida, cd no diretório criado.
Esse diretório deve conter o subdiretório debian/rules em questão.