Os comentários de Braiam e Patrick são absolutamente corretos, você deve começar com uma gravação decente ou então você achará uma luta difícil, e seu microfone é provavelmente o elemento mais importante. O princípio básico é que você sempre pode eliminar detalhes, mas nunca pode adicioná-lo.
Dito isto,sox
é um bom utilitário para manipular sons da linha de comando ou shell script, e pode aplicar filtros, como redução de ruído, que você mencionou, mas existem cargas. Este wiki é um bom lugar para começar a procurar o que você deseja. Você também precisará aprender um pouco sobre o processamento de som se também for novato, para entender quais filtros aplicar para obter um determinado efeito.
Você pode achar melhor visitar fóruns específicos do Raspberry Pi. O Google+ tem uma comunidade de framboesa . Há também um grupo específico aqui na troca de pilhas, Raspberry Pi
Finalmente, o blog de Steven Hickson tem um projeto que soa semelhante para o que você está querendo criar, que lhe dará inspiração e ponteiros.