Como este é um mau funcionamento do teclado, eu prefiro bloquear as teclas no nível do teclado.
Uma maneira simples de fazer isso é reatribuir as chaves para não fazer nada. Você pode fazer isso com o seguinte snippet de shell:
#!/bin/sh
xmodmap - <<EOF
keysym XF86WLAN = NoSymbol
keysym XF86Bluetooth = NoSymbol
EOF
Grave este script em um arquivo, torne-o executável ( chmod +x /path/to/script
) e adicione-o aos seus aplicativos de inicialização do Gnome.