"Permissões" nos sistemas de arquivos NTFS são uma opção de montagem. O NTFS não suporta permissões de estilo unix, ntfs-3g tem que falsificá-lo com ACLs NTFS.
Use umask=027 na linha de comando mount (ou em /etc/fstab ) para obter permissões de 640 .
Veja man mount.ntfs para mais detalhes e opções.