Você não pode! Para usar múltiplos núcleos / processadores, um programa tem que ser escrito para fazer isso, e factor
não é, mas ele não pode manipular números grandes o suficiente para fazer diferença de qualquer maneira:
> LANG=C factor 23324334789983497346867676887877338391988484874
factor: '23324334789983497346867676887877338391988484874' is too large
(esse número é apenas o resultado de acertar aleatoriamente o teclado numérico, o primeiro fator é bastante óbvio)