O OP me contou o domínio, é um .org (gov / NGO) e ainda não está funcionando (por exemplo, ainda não configurado, mas já registrado).
O domínio terá que ser configurado em um servidor DNS. Não, não recomendarei registrá-lo no mesmo VPS que o seu servidor WEB, isso não é uma boa prática.
O WHOIS também parece afirmar que nenhum servidor de nomes pode ser movido, então deve ter alguma forma de registrar o novo domínio / nome, seja abrindo um ticket com alguém, e dando-lhe os dados (por exemplo www.seudominio .org e seu VPS IP), ou eles o orientarão a registrá-lo em uma interface da Web e, possivelmente, a apontar para um servidor DNS (seu ou de outra organização)
Você terá que conversar com as pessoas que venderam / deram a você o domínio e esclarecer os procedimentos.
Obviamente, do seu lado, você precisa pelo menos definir o nome do vhost no Apache.