Não sei se foi digitado corretamente ou se é apenas um erro do código do Stackexchange.
Você digitou 2 arquivos e diz que são o mesmo arquivo.
/build/pkgname-1.0/android-ndk-r12/toolchains/arm-linux-androideabi-4.9/prebuilt/linux-x86/bin/arm-linux-androideabi-gcc
e
/build/pkgname-1.0/android-ndk-r12/toolchains/arm-linux-androideabi-4.9/prebuilt/linux-x86/bin:arm-linux-androideabi-gcc
Um tem /
após .../bin
e outro tem :
Veja também os direitos do arquivo.