Você já encontrou o repositório do Github no qual o desenvolvimento desses arquivos de tema ocorre. Eu não os vejo empacotados no Mint, então você terá que instalá-los manualmente usando esse repositório como fonte.
Como você não elabora o que fez depois de descobrir o repositório (você mudou com sucesso para a nova versão dos temas?), eu começaria verificando se você está realmente usando os novos arquivos de tema.
Para fazer isso, sugiro alterar alguma especificação de cor nos novos arquivos para algo perceptível, reinicie o Geany e verifique se você vê a mudança de cor nos arquivos realçados pela sintaxe.
Se isso for feito, verifique se os erros observados no comportamento de realce aparecem apenas no seu tema favorito ou em todos eles. Finalmente, se tudo isso não apontar para a origem de seus problemas, entre em contato com os desenvolvedores para ver se você está acertando um bug.
No meu teste, no entanto, vejo 0,25 e os novos arquivos de tema funcionando bem.