Eu enfrentei um problema semelhante. Isso é o que me ajudou a resolvê-lo.
No meu computador, as configurações do vim que tornaram muitas coisas bonitas são armazenadas em /usr/shar/vim/vim*/defaults.vim , mas este arquivo foi lido somente se não houver ~/.vimrc . Portanto, se você puder copiar esse arquivo inteiro para você ~/.vimrc , ou se você for um administrador e quiser fazer uma alteração para todos os usuários, modifique o arquivo em si. Apenas comente a linha que diz set mouse=a .