Ok. Eu não tenho uma solução, mas acho que encontrei a causa.
Eu ainda posso navegar pelo meu disco rígido via Windows, mas não consigo acessar nenhum arquivo, porque eles são relatados com 0 bytes no disco. Então, meu sistema de arquivos está corrompido ou eu acabei de inventar a compactação mais eficiente ... (não acho que seja o último;))
Eu não sei se foi causado por ntfs-3g ou não, mas é definitivamente por isso que recebo esses "erros". (Descrição tecnicamente correta do que está acontecendo.)
Screenshot de uma janela de propriedades do Windows:
Obrigado pelos seus comentários de qualquer maneira!