Há uma opção para isso nas configurações de digitação: abra gnome-tweak-tool e na seção Digitação expanda Opções de compatibilidade variadas e marque a opção "NumLock on : dígitos, Shift muda para as teclas de seta, NumLock desligado: sempre teclas de seta (como no MS Windows) "
Ou você pode usar dconf-editor , navegar para org > gnome > área de trabalho > entrada-fontes > xkb-opções e adicionar 'numpad:microsoft' aos valores existentes.
Para uma solução independente de desktop, você pode usar setxkbmap -option numpad:microsoft em seus arquivos de inicialização do X.