Instale o dconf-editor
sudo apt-get install dconf-editor
Inicie o aplicativo e navegue até
org.gnome.terminal.legacy
Abra a categoria profiles:
e selecione o perfil errado ou verifique todos os perfis.
No painel direito, você verá uma tecla custom-command . Remova o valor ou use o Botão Definir como Padrão no painel inferior.