então a abordagem seria executar remotamente comandos que copiam os arquivos via sudo para / tmp na máquina remota, muda seu proprietário para o usuário conectado e, em seguida, os copia remotamente de / tmp:
ssh [email protected] "sudo cp -R some_directory /tmp"
ssh [email protected] "sudo chown -R username:username /tmp/some_directory"
scp -q -r [email protected]:/tmp/some_directory copy_it/here/
ssh [email protected] "rm -r /tmp/some_directory"