Eu encontrei uma solução estranha para fazer as chaves funcionar se alguém está recebendo o mesmo problema, espero que isso ajude. Não é a melhor solução com certeza porque você tem que fazer isso toda vez que o Ubuntu iniciar, mas pelo menos você pode usar as teclas multimídia quando necessário.
Desconecte o teclado ao iniciar o sistema (depois do menu do Grub) e conecte-o novamente antes do menu de login.