A questão não foi fechada, mas está atrás de tudo, incluindo o papel de parede.
Alterar as configurações da janela resolveu o problema:
own_window yes
own_window_type normal
own_window_transparent no
own_window_argb_visual yes
own_window_type normal
own_window_class conky-semi
own_window_hints undecorate,sticky,skip_taskbar,skip_pager,below
own_window_argb_value 128
own_window_colour 000000