Eu tentaria primeiro isso:
chattr -i [directory]
chattr -a [directory]
chattr
altera os atributos de arquivo (e diretório) em um sistema de arquivos Linux
chattr +[option] adds an attribute
chattr -[option] removes and attribute
O sinalizador somente de acréscimo 'a'
impede a remoção de um diretório e de quaisquer arquivos ou diretórios criados nele.
Um item com o atributo 'i'
não pode ser modificado: não pode ser excluído nem renomeado.