Para praticamente qualquer software em que o código-fonte esteja disponível, você quase sempre conseguirá que ele funcione perfeitamente em qualquer distribuição Linux (e normalmente qualquer variante do tipo UNIX)
No entanto, existem vários produtos de software "comerciais" que funcionam apenas no RedHat. Um exemplo vergonhoso é o HP OpenView (particularmente desde que Bruce Perens, um ex-DPL trabalhou para a HP por vários anos e o Debian foi por um curto período de tempo a distribuição recomendada pela HP).
Esses produtos geralmente têm scripts de instalação que dependem de arquivos de configuração específicos ou de locais de arquivos do RedHat; ou exigir módulos do kernel que foram pré-construídos em kernels distribuídos pela RedHat.
Através da dedicação, você pode ser capaz de fazê-los correr, mas muitas vezes é uma grande dor no rabo. E você estará executando em uma configuração totalmente sem suporte, no que diz respeito ao fornecedor.