Assumindo que o FollowSymLinks está definido corretamente, suponho que o problema é que o seu diretório home não permite que mais ninguém o atravesse ( As permissões do diretório pai são importantes ao acessar um subdiretório? ). Esse é o padrão no Fedora; parece o padrão no Ubuntu é mais permissivo, e é por isso que mudar para isso funcionou.
Supondo que este seja o caso, a mensagem de erro não é a mais informativa, mas também não está errada.
Eu aprecio que você esteja frustrado, mas não acho que algo realmente misterioso esteja acontecendo aqui, nem algo particularmente errado; o padrão do Fedora é apenas mais seguro / sensível à privacidade. (Para o registro, também é bastante fácil para que isso funcione com o SELinux ativado e oferecendo uma camada extra de proteção, se você quiser.
Então, aviso: Eu trabalho no Fedora, e seria incrível se todos usassem o Fedora - mas tudo bem se eles não o fizerem; é um grande mundo Linux. No entanto, aqui está a coisa ... Mais cedo ou mais tarde, você vai encontrar algo parecido com isso no Ubuntu, onde uma mensagem de erro estranha não conta toda a história. E pode ser que jogar fora a janela e ir ao Arch ou ao openSUSE ou $ flavoroftheday - ou até mesmo ao Fedora - resolva o seu problema, só porque temos uma configuração um pouco diferente . Mas quanto tempo até o próximo problema? Eu sei que você realmente quer apenas fazer o seu trabalho e não ter o seu computador no caminho, mas no final das contas, ficar com raiva e mudar tudo vai resultar em mais trabalho.