A maioria das distribuições significativas (incluindo o Fedora e o Ubuntu) preferem instalar a partir de um cd-rom de inicialização ou usb-stick atualmente. O Windows não precisa fazer parte do processo.
O Wubi é um aplicativo do Windows que pode executar o Linux a partir de um arquivo do Windows, fingindo ser um disco de inicialização. Sua finalidade é ter impacto zero no sistema Windows:
You keep Windows as it is, Wubi only adds an extra option to boot into Ubuntu. Wubi does not require you to modify the partitions of your PC, or to use a different bootloader, and does not install special drivers. It works just like any other application.
O LiveCD do Fedora e LiveCD do Ubuntu e até mesmo o minúsculo DSL LiveCD são os métodos de instalação mais simples.