Você deve mv do arquivo sair do caminho:
mv /etc/bluetooth/main.conf /etc/bluetooth/main.conf.old
apt-get -o DPkg::options::=--force-confmiss --reinstall install bluez
Eu não sei se você pode obter apt para sobrescrever um arquivo de configuração existente, é por isso que você deve movê-lo para fora do caminho primeiro.