Sim, é. Não há nenhum requisito para partições separadas em uma instalação do Linux, é apenas uma boa ideia. Ter certas partições separadas protege você de perder tudo se uma única partição falhar. Também é bom ter seu $HOME
em uma partição separada, pois isso facilita a reinstalação ou a alteração das distribuições.
No entanto, você está livre para configurar o Linux em uma única partição e não deve ter absolutamente nenhum problema com ele.
A melhor opção, no entanto, é criar uma quarta partição como uma Partição Estendida . Isso permite criar várias partições lógicas dentro dele e, assim, ter um sistema Linux com partições separadas para determinadas pastas.