Isso é muito fácil de fazer com Awk:
awk '/Label 3/ { print $3 >>"F3.csv" } /Label 5/ { print $3>>"F5.csv" }'
Isto irá acrescentar o valor das linhas que começam com Label 3 e Label 5 no arquivo F3.csv e F5.csv correspondentemente.
Isso também pode ser escrito de maneira um pouco mais compacta:
awk '/Label 3|Label 5/ { print $3 >> "F"$2".csv"}'
usando um fato de que o nome do arquivo de destino pode ser deduzido do sufixo da etiqueta
(obrigado @don_crissti!)