Definir um disco rígido para dormir já é feito pelo sistema operacional após um período de inatividade.
Na verdade, você realmente não ganha nada configurando-a para dormir manualmente; e se o sistema operacional precisar ou estiver usando, ele não terá nenhum efeito visível.
Se você realmente não quiser usá-lo, desmonte-o com
sudo umount /mnt/Backup
No entanto, é essencial que você o monte em seus scripts de backup, caso contrário, o backup será despejado no ponto de montagem no outro disco.
Esteja ciente de ter / fazer backups no mesmo equipamento. Se o equipamento for roubado, perdido ou tiver um problema elétrico ou de kernel, você poderá perder o conteúdo de ambos os discos.
Um caso externo com o disco ou conectado ao seu roteador em casa seria muito mais seguro.