É obrigatório aguardar até que o ícone do dispositivo USB desapareça. Embora ainda exista, o sistema está liberando os buffers do sistema de arquivos para o seu dispositivo.
Você também pode usar sync
do terminal / shell e esperar que ele seja concluído ou você pode
use gnome-disks
(também conhecido como gnome-disk-utility
ou GNOME Disks
ou palimpsest
)
para sincronizar e desconectar com segurança o dispositivo USB do sistema.
Felicidades,