Você deve usar as ferramentas para o sistema de arquivos em uso.
Neste caso, você precisa de ntfs-3G-Advanced para poder ler junções NTFS e precisa usar as funções de junção do Windows dentro do Windows ( mklink Link Target
), pois ainda não existe uma ferramenta (mesmo no pacote avançado) para criar junções do Windows a partir do Linux.
Observação: Junções são a versão NTFS dos links simbólicos EXT.