[update] Algumas linhas possuem muitos campos (separados em branco). Experimente grep em vez de awk :
grep -E -o '^[^[:space:]]+' your_input_file | uniq
Eu recomendaria contra usar sed para isso, já que faria muito trabalho extra em cada linha (para remover o fim da linha) em um arquivo muito grande. Mesmo para awk : a análise de linha é desnecessária.