Sua pergunta sugere que o Debian usa arquivos temporários para todas as gravações, o que não é o caso. Este é simplesmente o padrão para mp3gain
.
Na versão 1.4.3-2, o mantenedor do pacote (Stefan Fritsch) decidiu que, como gravar um arquivo temporário é muito mais rápido no ReiserFS, este seria o padrão no Debian. Isso foi obtido do patch em < a href="https://packages.debian.org/source/squeeze/mp3gain"> link
Os mantenedores de pacotes em outras distros presumivelmente não concordaram com Stefan e, portanto, não alteraram o padrão de não usar arquivos temporários.