Esta situação resolveu-se. Embora previamente repetido com cada atualização individual, o lote mais recente de atualizações não exibiu essa sugestão. Todas as bibliotecas R estão funcionando e atualizadas.
Por que o apt-get está me dizendo para remover pacotes que eu preciso? E como eu digo para calar a boca?
Estou executando um EC2 com o Ubuntu 14.04 e R 3.1.2 e o Rstudio-server.
Acabei de executar apt-get update e upgrade e agora o apt-get está me dizendo:
The following packages were automatically installed and are no longer required:
icu-devtools libicu-dev r-cran-assertthat r-cran-bh r-cran-bibtex
r-cran-bitops r-cran-chron r-cran-colorspace r-cran-data.table r-cran-dbi
r-cran-devtools r-cran-dichromat r-cran-digest r-cran-dplyr r-cran-evaluate
r-cran-formatr r-cran-gdata r-cran-gender r-cran-ggplot2 r-cran-gridextra
r-cran-gtable r-cran-gtools r-cran-highr r-cran-httr r-cran-igraph
r-cran-jsonlite r-cran-knitcitations r-cran-knitr r-cran-labeling
r-cran-lazyeval r-cran-lubridate r-cran-magrittr r-cran-markdown
r-cran-memoise r-cran-mime r-cran-munsell r-cran-nlp r-cran-opennlp
r-cran-opennlpdata r-cran-plotrix r-cran-plyr r-cran-proto
r-cran-qdapdictionaries r-cran-qdapregex r-cran-qdaptools r-cran-r6
r-cran-rcolorbrewer r-cran-rcpp r-cran-rcurl r-cran-refmanager
r-cran-reports r-cran-reshape2 r-cran-rjsonio r-cran-rstudioapi
r-cran-scales r-cran-slam r-cran-stringdist r-cran-stringi r-cran-stringr
r-cran-tm r-cran-venneuler r-cran-whisker r-cran-wordcloud r-cran-xlsx
r-cran-xlsxjars r-cran-xml
Use 'apt-get autoremove' to remove them.
Mas eu preciso dessas bibliotecas. Na verdade eu corri apt-get autoremove e quebrou coisas - havia outras bibliotecas ( qdap ) que dependiam delas. Claro que fiz um instantâneo primeiro.
Anteriormente, instalei a biblioteca R qdap , que requer a biblioteca R rjava , que requer o Java jdk. Postei as etapas que fiz aqui: link
Tudo parece estar funcionando bem. Mas é isso? Estou incomodado com a mensagem do apt-get se repetindo de novo e de novo para cada ação. Como o Apt pode estar errado?
Esta situação resolveu-se. Embora previamente repetido com cada atualização individual, o lote mais recente de atualizações não exibiu essa sugestão. Todas as bibliotecas R estão funcionando e atualizadas.