O problema é causado porque você moveu eclipse para um local fora do diretório em que você o instalou.
Em vez de mover eclipse para um diretório em seu caminho, crie um link flexível para o executável. Supondo que o Eclipse é extraído dentro de seu diretório inicial:
sudo ln -s /home/masi/eclipse/eclipse /usr/local/bin/eclipse
Você pode executar eclipse sem prefixá-lo com o caminho.
