As probabilidades são de que os dois scripts estejam em diretórios diferentes. Um dos diretórios está no PATH enquanto o outro não está.
Você pode usar o comando type
para testar se um arquivo está presente no $ PATH do seu shell atual.
$ type start_dropbox.bash
start_dropbox.bash is /home/saml/bin/start_dropbox.bash
Veja este U & L Q & A " Como posso testar para ver se existe uma aplicação em $ PATH? " para uma cobertura mais completa.