O Fedora Core 3 chegou ao fim da vida em 16 de janeiro de 2006. Isso significa que não há atualizações de segurança há mais de cinco anos. Meia década!
Este é o problema que você precisa resolver:
Since I am not permitted to upgrade the OS, which would result in loss of important data,
E se o sistema morresse? Ou, mais importante, e se vulnerabilidades conhecidas no Firefox 2.0 e no antigo kernel do Linux que você está executando permitirem que um invasor comprometa sua máquina e destrua seus dados?
A resposta à sua pergunta é: se você realmente precisa dessa caixa do FC3 inalterada, você precisa proteger esse sistema o mais completamente possível . Ele não deveria estar falando com a internet pública, e eu ficaria bastante desconfiada em colocá-lo perto da minha rede de internet também. Esta não é uma preocupação teórica - é um risco real. E colocar flash lá só vai aumentar esse risco.
Então, a resposta realmente precisa ser: não use esse sistema . Se você precisa de Flash - ou navegação na web em geral! - use um sistema diferente. E esse sistema diferente pode (e deve!) Executar um sistema operacional atual e moderno, e assim rodar o Flash não será problema.
E encontre uma maneira de proteger seus dados. Porque esse problema só vai ficar mais difícil, não mais fácil.