Você pode usar o GNU date
para converter uma cadeia de data e hora em um número de segundos (desde "a época", 1º de janeiro de 1970). A partir daí, é uma simples comparação aritmética
datetime='2016-08-31T15:38:18Z'
timeago='90 days ago'
dtSec=$(date --date "$datetime" +'%s')
taSec=$(date --date "$timeago" +'%s')
echo "INFO: dtSec=$dtSec, taSec=$taSec" >&2
[ $dtSec -lt $taSec ] && echo too old