O comando convert do Imagemagick pode alterar um TIFF de várias páginas em vários arquivos
convert multipage.tif single%d.tif
O %d será substituído por um número de página criando as imagens individuais.
Você também pode converter para outros formatos de imagem ao mesmo tempo, por exemplo
convert multipage.tif single%d.png
Para sua outra parte da pergunta, não sei ao certo como um espectador saberia como separar uma imagem da outra ao passar por um canal.
Em uma pergunta semelhante no SuperUser, houve uma discussão sobre alguns problemas de formatação que alguns tipos de arquivos tiff de várias páginas parecem ter. Apenas no caso, você pode querer olhar para link